Bereits im Mittelalter gab es Doppelrohrblatt-Instrumente wie den Bass-Pommer und den Dulzian. Im 17. Jahrhundert begann jedoch erst die maßgebliche Karriere des heutigen Fagottes. In dieser Zeit begann die Entwicklung der bündelartigen Herstellung von tiefen Doppelrohrblatt-Instrumenten - anfangs noch ohne Klappen. Doch mit der allmählichen Weiterentwicklung des Fagotts wurde das Instrument auch mit immer mehr Klappen bestückt.
Im 19. Jahrhundert entstand schließlich das heute noch gültige Heckelsystem (deutsches System).
Der vielleicht ausgefallenste Vorgänger des Fagotts ist das Rankette, wegen seiner vielen Windung auf / in engstem Raum auch Wurstfagott genannt.